MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Allochromatium vinosum DSM 180 plasmid pALVIN01

Total Repeats: 1803

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013852	GCC	2	6	56	61	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947675
2	NC_013852	GCC	2	6	95	100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947675
3	NC_013852	CGG	2	6	115	120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947675
4	NC_013852	GGC	2	6	127	132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947675
5	NC_013852	CCGC	2	8	162	169	0 %	0 %	25 %	75 %	288947675
6	NC_013852	CCG	2	6	204	209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947675
7	NC_013852	GTG	2	6	254	259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947675
8	NC_013852	CCG	2	6	276	281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947675
9	NC_013852	CCG	2	6	399	404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947675
10	NC_013852	TGC	2	6	429	434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947675
11	NC_013852	GTGC	2	8	463	470	0 %	25 %	50 %	25 %	288947675
12	NC_013852	GGC	2	6	482	487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947675
13	NC_013852	TGC	2	6	525	530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947675
14	NC_013852	GAT	2	6	586	591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947675
15	NC_013852	CG	3	6	669	674	0 %	0 %	50 %	50 %	288947675
16	NC_013852	CGT	2	6	696	701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947675
17	NC_013852	AGTC	2	8	754	761	25 %	25 %	25 %	25 %	288947675
18	NC_013852	GAT	2	6	842	847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947675
19	NC_013852	GC	3	6	859	864	0 %	0 %	50 %	50 %	288947675
20	NC_013852	GAT	2	6	884	889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947675
21	NC_013852	CG	3	6	897	902	0 %	0 %	50 %	50 %	288947675
22	NC_013852	TCG	2	6	1041	1046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947675
23	NC_013852	ACG	2	6	1059	1064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947675
24	NC_013852	CTG	2	6	1067	1072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947675
25	NC_013852	GC	3	6	1100	1105	0 %	0 %	50 %	50 %	288947675
26	NC_013852	GTG	2	6	1106	1111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947675
27	NC_013852	CGG	2	6	1264	1269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947676
28	NC_013852	CGC	2	6	1312	1317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947676
29	NC_013852	GGC	2	6	1323	1328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947676
30	NC_013852	GCG	2	6	1338	1343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947676
31	NC_013852	CG	3	6	1368	1373	0 %	0 %	50 %	50 %	288947676
32	NC_013852	TGG	2	6	1401	1406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947676
33	NC_013852	TCG	2	6	1411	1416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947676
34	NC_013852	TCGCC	2	10	1426	1435	0 %	20 %	20 %	60 %	288947676
35	NC_013852	GCG	2	6	1458	1463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947676
36	NC_013852	CGC	2	6	1478	1483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947676
37	NC_013852	TGG	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947676
38	NC_013852	GGT	2	6	1728	1733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947676
39	NC_013852	CGCGG	2	10	1747	1756	0 %	0 %	60 %	40 %	288947676
40	NC_013852	GGA	2	6	1799	1804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947676
41	NC_013852	GCC	2	6	1822	1827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947676
42	NC_013852	TG	4	8	1828	1835	0 %	50 %	50 %	0 %	288947676
43	NC_013852	CGTC	2	8	1873	1880	0 %	25 %	25 %	50 %	288947676
44	NC_013852	ATC	2	6	2067	2072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947676
45	NC_013852	TTTCA	2	10	2073	2082	20 %	60 %	0 %	20 %	288947676
46	NC_013852	CTG	2	6	2199	2204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947676
47	NC_013852	ACG	2	6	2219	2224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947676
48	NC_013852	CCG	2	6	2278	2283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947676
49	NC_013852	CG	4	8	2295	2302	0 %	0 %	50 %	50 %	288947676
50	NC_013852	GAT	2	6	2340	2345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947676
51	NC_013852	GGC	2	6	2441	2446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947677
52	NC_013852	CG	3	6	2455	2460	0 %	0 %	50 %	50 %	288947677
53	NC_013852	GCT	2	6	2480	2485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947677
54	NC_013852	GCGG	2	8	2498	2505	0 %	0 %	75 %	25 %	288947677
55	NC_013852	CG	3	6	2507	2512	0 %	0 %	50 %	50 %	288947677
56	NC_013852	TGC	2	6	2515	2520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947677
57	NC_013852	CG	3	6	2596	2601	0 %	0 %	50 %	50 %	288947677
58	NC_013852	CGC	2	6	2657	2662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947677
59	NC_013852	GCC	3	9	2691	2699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947677
60	NC_013852	GC	3	6	2727	2732	0 %	0 %	50 %	50 %	288947677
61	NC_013852	TGA	2	6	2756	2761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947677
62	NC_013852	CTG	2	6	2787	2792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947677
63	NC_013852	GAC	2	6	2829	2834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947677
64	NC_013852	GGC	2	6	2873	2878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947677
65	NC_013852	CG	3	6	2890	2895	0 %	0 %	50 %	50 %	288947677
66	NC_013852	CTCG	2	8	2942	2949	0 %	25 %	25 %	50 %	288947677
67	NC_013852	GAG	2	6	2988	2993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947677
68	NC_013852	CG	3	6	3022	3027	0 %	0 %	50 %	50 %	288947677
69	NC_013852	AGC	2	6	3031	3036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947677
70	NC_013852	TGA	2	6	3052	3057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947677
71	NC_013852	GGCC	2	8	3065	3072	0 %	0 %	50 %	50 %	288947677
72	NC_013852	CG	3	6	3097	3102	0 %	0 %	50 %	50 %	288947677
73	NC_013852	GCC	2	6	3105	3110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947677
74	NC_013852	AGC	2	6	3139	3144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947677
75	NC_013852	GCG	2	6	3214	3219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947677
76	NC_013852	GGC	2	6	3281	3286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947677
77	NC_013852	GGA	2	6	3311	3316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947677
78	NC_013852	CGG	2	6	3361	3366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947677
79	NC_013852	GCT	2	6	3428	3433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947677
80	NC_013852	CAGG	2	8	3443	3450	25 %	0 %	50 %	25 %	288947677
81	NC_013852	CGG	2	6	3451	3456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947677
82	NC_013852	GCCAT	2	10	3529	3538	20 %	20 %	20 %	40 %	288947677
83	NC_013852	CGG	2	6	3545	3550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947677
84	NC_013852	CGA	2	6	3551	3556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947677
85	NC_013852	CGC	2	6	3662	3667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947677
86	NC_013852	GCC	2	6	3779	3784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947677
87	NC_013852	CGG	2	6	3830	3835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947677
88	NC_013852	GAC	2	6	3861	3866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947677
89	NC_013852	GC	3	6	3947	3952	0 %	0 %	50 %	50 %	288947677
90	NC_013852	CG	3	6	4089	4094	0 %	0 %	50 %	50 %	288947677
91	NC_013852	CGG	2	6	4102	4107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947677
92	NC_013852	GC	3	6	4152	4157	0 %	0 %	50 %	50 %	288947677
93	NC_013852	CCGC	2	8	4165	4172	0 %	0 %	25 %	75 %	288947677
94	NC_013852	AAG	2	6	4208	4213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288947678
95	NC_013852	AAG	2	6	4217	4222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288947678
96	NC_013852	ACA	2	6	4239	4244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288947678
97	NC_013852	AGC	3	9	4245	4253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947678
98	NC_013852	GCG	2	6	4274	4279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947678
99	NC_013852	CGC	2	6	4291	4296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947678
100	NC_013852	CCGC	2	8	4302	4309	0 %	0 %	25 %	75 %	288947678
101	NC_013852	CGA	2	6	4402	4407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947678
102	NC_013852	CGC	2	6	4437	4442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947678
103	NC_013852	ACA	2	6	4554	4559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	288947678
104	NC_013852	GCG	2	6	4573	4578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947678
105	NC_013852	CGG	2	6	4593	4598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947678
106	NC_013852	AGG	2	6	4623	4628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947678
107	NC_013852	TGG	2	6	4751	4756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947678
108	NC_013852	GGA	2	6	4762	4767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947678
109	NC_013852	GGC	2	6	4882	4887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947678
110	NC_013852	GTT	2	6	4900	4905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	288947678
111	NC_013852	GAAGCA	2	12	4960	4971	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	288947678
112	NC_013852	CGG	2	6	5035	5040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947678
113	NC_013852	CCG	2	6	5111	5116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947678
114	NC_013852	GCT	2	6	5164	5169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947678
115	NC_013852	GGCT	2	8	5204	5211	0 %	25 %	50 %	25 %	288947678
116	NC_013852	GCC	2	6	5233	5238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947678
117	NC_013852	CGC	3	9	5269	5277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947678
118	NC_013852	AAGA	2	8	5318	5325	75 %	0 %	25 %	0 %	288947678
119	NC_013852	TGG	2	6	5346	5351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947678
120	NC_013852	ACC	2	6	5390	5395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947678
121	NC_013852	TGGC	2	8	5417	5424	0 %	25 %	50 %	25 %	288947678
122	NC_013852	TG	3	6	5430	5435	0 %	50 %	50 %	0 %	288947678
123	NC_013852	GTCG	2	8	5598	5605	0 %	25 %	50 %	25 %	288947679
124	NC_013852	CGCCCG	2	12	5625	5636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947679
125	NC_013852	CTC	2	6	5664	5669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	288947679
126	NC_013852	GC	3	6	5699	5704	0 %	0 %	50 %	50 %	288947679
127	NC_013852	CG	3	6	5722	5727	0 %	0 %	50 %	50 %	288947679
128	NC_013852	CTG	2	6	5800	5805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947679
129	NC_013852	GC	3	6	5875	5880	0 %	0 %	50 %	50 %	288947679
130	NC_013852	CCGA	2	8	5950	5957	25 %	0 %	25 %	50 %	288947679
131	NC_013852	ACC	2	6	5977	5982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947679
132	NC_013852	CAACG	2	10	6013	6022	40 %	0 %	20 %	40 %	288947679
133	NC_013852	CGC	2	6	6051	6056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947679
134	NC_013852	GAA	2	6	6201	6206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288947679
135	NC_013852	GC	3	6	6209	6214	0 %	0 %	50 %	50 %	288947679
136	NC_013852	GAG	2	6	6223	6228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947679
137	NC_013852	TCCG	2	8	6327	6334	0 %	25 %	25 %	50 %	288947679
138	NC_013852	GCT	2	6	6342	6347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947679
139	NC_013852	CGG	2	6	6354	6359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947679
140	NC_013852	GCT	2	6	6390	6395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947679
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142	NC_013852	GGC	2	6	6408	6413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947679
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144	NC_013852	CCA	2	6	6428	6433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	288947680
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146	NC_013852	AAG	3	9	6486	6494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	288947680
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149	NC_013852	GAT	2	6	6609	6614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947680
150	NC_013852	AGG	2	6	6619	6624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947680
151	NC_013852	TGC	2	6	6625	6630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947680
152	NC_013852	GC	3	6	6629	6634	0 %	0 %	50 %	50 %	288947680
153	NC_013852	CGG	2	6	6635	6640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947680
154	NC_013852	GCG	2	6	6658	6663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947680
155	NC_013852	ATC	2	6	6681	6686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947680
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157	NC_013852	TGC	2	6	6769	6774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947680
158	NC_013852	GAG	2	6	6807	6812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947680
159	NC_013852	GC	3	6	6869	6874	0 %	0 %	50 %	50 %	288947681
160	NC_013852	CACGCC	2	12	6982	6993	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	288947681
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164	NC_013852	TG	3	6	7195	7200	0 %	50 %	50 %	0 %	288947681
165	NC_013852	TGG	2	6	7325	7330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947681
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173	NC_013852	CCGGT	2	10	7611	7620	0 %	20 %	40 %	40 %	288947681
174	NC_013852	TGAA	2	8	7632	7639	50 %	25 %	25 %	0 %	288947681
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178	NC_013852	GGC	2	6	7717	7722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947681
179	NC_013852	GGA	2	6	7756	7761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	288947681
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181	NC_013852	ATG	2	6	7845	7850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	288947681
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248	NC_013852	CGGTGA	2	12	13187	13198	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	288947685
249	NC_013852	GTCG	2	8	13224	13231	0 %	25 %	50 %	25 %	288947685
250	NC_013852	GGT	2	6	13263	13268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947685
251	NC_013852	GCC	2	6	13315	13320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947685
252	NC_013852	CCGA	2	8	13342	13349	25 %	0 %	25 %	50 %	288947685
253	NC_013852	GCC	2	6	13354	13359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947685
254	NC_013852	TGC	2	6	13415	13420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947685
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258	NC_013852	CCGA	2	8	13486	13493	25 %	0 %	25 %	50 %	288947685
259	NC_013852	CTG	2	6	13522	13527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	288947685
260	NC_013852	GC	4	8	13560	13567	0 %	0 %	50 %	50 %	288947685
261	NC_013852	GC	3	6	13662	13667	0 %	0 %	50 %	50 %	288947685
262	NC_013852	GGCCCA	2	12	13689	13700	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	288947685
263	NC_013852	GC	3	6	13757	13762	0 %	0 %	50 %	50 %	288947685
264	NC_013852	TGGC	2	8	13990	13997	0 %	25 %	50 %	25 %	288947686
265	NC_013852	GCGA	2	8	14007	14014	25 %	0 %	50 %	25 %	288947686
266	NC_013852	GGC	2	6	14124	14129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947686
267	NC_013852	CGC	2	6	14198	14203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	288947686
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272	NC_013852	TCA	2	6	14428	14433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	288947686
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388	NC_013852	GCG	2	6	21910	21915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947697
389	NC_013852	GCA	2	6	21994	21999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	288947697
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392	NC_013852	TGG	2	6	22186	22191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947698
393	NC_013852	TGG	2	6	22195	22200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	288947698
394	NC_013852	CGG	2	6	22210	22215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947698
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397	NC_013852	TC	4	8	22346	22353	0 %	50 %	0 %	50 %	288947698
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400	NC_013852	GCG	2	6	22505	22510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	288947698
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442	NC_013852	CG	3	6	25933	25938	0 %	0 %	50 %	50 %	288947702
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